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在大多数生物技术和制药工厂内，生产通常涉及一系列的生物反应器和下游工艺设备。大多数工厂的生物反应器通常采取批次生产模式，在严格受控的条件下，生产规范严格的产品。
为了确保最终产品的质量、一致性和安全性，所有产品能够接触到的表面，应该满足严苛的卫生要求。一个经过有效设计、验证、实施和监控的CIP程序，能够提高清洗效果，确保始终如一的高质量产品的生产。
程序起始：这一步是CIP程序的开始，在确定产品生产已经完成后，建立CIP回路边界，并确定液体控制装置（泵、阀门、管路）都可以使用。
清洗：通常是碱洗或酸洗。这一步的目的是从产品接触的表面上尽可能去除产品污垢和相关微生物。由于需要相对长时间的冲洗，为了实现的操作经济性，需要对清洗溶液进行循环使用。